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第四种是基于联合标签的技术，为了追求更高的通量。它通过多轮的混合、标记、再分组，像编密码一样为每个细胞核生成一个极其复杂的组合标签，理论上可以达到百万甚至更高的通量。但它的操作流程非常繁琐，且容易在过程中丢失细胞，限制了其广泛应用。

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另外，它天然兼容成像技术，可以轻松整合免疫荧光（看蛋白）和抗体条码（CITE-seq），在一次实验中获得基因、蛋白、形态三个维度的数据。

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